Analisis transkriptom mengungkapkan kemungkinan mekanisme antitumor polisakarida intraseluler dari Phaeodactylum tricornutum pada sel kanker serviks HeLa

Abstrak
Sebagai zat antitumor alami yang tidak beracun, polisakarida rumput laut telah menjadi pusat penelitian. Untuk menyelidiki efek anti-tumor dan mekanisme polisakarida intraseluler Phaeodactylum tricornutum, polisakarida intraseluler dari Phaeodactylum tricornutum (PRP) diisolasi dan dimurnikan dalam makalah ini. Efek penghambatan dari berbagai komponen polisakarida yang dimurnikan pada sel kanker serviks diselidiki, dan mekanisme anti-tumor diungkapkan oleh analisis transkriptom. Hasil penelitian menunjukkan bahwa keempat komponen polisakarida murni P.tricornutum dapat menghambat proliferasi sel HeLa, mengurangi viabilitas sel dan mengubah morfologi sel. Hasil uji CCK-8 menunjukkan bahwa di antara keempat komponen polisakarida yang dimurnikan, PRP4 menunjukkan efek penghambatan terbaik. Analisis transkriptom menunjukkan bahwa ada 806 gen yang diekspresikan secara berbeda dalam kelompok perlakuan PRP4 dibandingkan dengan kelompok kontrol, termasuk 570 gen yang diatur ke atas dan 236 gen yang diatur ke bawah. Hasil pengayaan fungsi gen menunjukkan bahwa gen yang diekspresikan secara berbeda (DEG) secara signifikan diperkaya dalam apoptosis dan proses biologis terkait tumor, yang terlibat dalam berbagai jalur pensinyalan terkait kanker dan apoptosis. Jaringan interaksi protein-protein mengidentifikasi 10 DEGS sebagai gen sentral, termasuk IL1B, CXCL8, MMP9, THBS1, CXCR4, LOX, TGFB1, VWF, PTGS2, dan TLR4. Hasil kami menunjukkan bahwa PRP4 merupakan agen terapi kanker yang menjanjikan